1 Mayıs 2005 tarihinde İstanbul’da, 40 ülkeden üç yüzü aşkın sivil toplum kuruluşunun katılımıyla Türkiye Gönüllü Teşekküller Vakfı (TGTV) öncülüğünde “Değişen Dünyada Yeni Bir Vizyon Arayışı” başlıklı bir konferans düzenlendi.
Konferansın ilk gününde Türkiye Büyük Millet Meclisi Başkanı Sayın Bülent Arınç, ikinci gününde ise Dışişleri Bakanı Sayın Abdullah Gül birer konuşma yaptılar. Konferansın son oturumunda kurulması planlanan Birliğin taslak tüzüğü tartışmaya açıldı ve konferansa katılan temsilcilerin oylarıyla İslam Dünyası Sivil Toplum Kuruluşları Birliği’nin (İDSB) kurulmasına karar verildi.
Türkiye Cumhuriyeti Başbakanı Sayın Recep Tayyip Erdoğan, yeni kurulan Birliğin müjdesini Türkiye Büyük Millet Meclisinde kamuoyuyla paylaştı.
İslam dünyasının farklı bölgelerinde faaliyet gösteren sivil toplum kuruluşları arasında, ortak değerler ekseninde sürdürülebilir iş birliği oluşturmayı hedefleyen İDSB’nin ilk dönem Genel Sekreterliğine Necmi Sadıkoğlu, Türkiye temsilciliğine ise Av. Ali Kurt seçildi. Birliğin merkezi İstanbul olarak kabul edildi.
İDSB’nin kuruluşu, 3335 sayılı Uluslararası Nitelikteki Teşekküllerin Kurulması Hakkında Kanun kapsamında, uluslararası kuruluş statüsünde 31 Aralık 2005 tarihli Bakanlar Kurulu kararıyla resmiyet kazandı.
2022 yılından itibaren İDSB Genel Sekreterliği görevini Eyüp Akbal yürütmektedir. “6 Kıta, 66 Ülke, Tek Millet” ilkesiyle çalışmalarına devam eden İDSB’nin hâlihazırda 488 üyesi bulunmaktadır.